肝癌与癌旁组织间TFAM差异结合蛋白的筛选鉴定及初步功能分析

摘要

目的 探索线粒体转录因子A(TFAM)结合蛋白在肝癌发生发展过程中的差异特征，为肝癌的发病机制及治疗策略提供新的视角和理论依据。方法 利用4D-FastDIA定量蛋白质组学技术，对肝癌组织及其配对癌旁组织样本展开了全面分析，筛选出肝癌组织中与TFAM结合存在显著差异的蛋白。通过生物信息学手段，对这些差异结合蛋白开展了GO功能富集和KEGG通路富集分析；在细胞水平，利用免疫共沉淀及免疫印迹实验验证了TFAM与关键结合蛋白的相互作用关系；并通过EdU实验探究了这些关键结合蛋白在肝癌细胞增殖中的作用。结果 蛋白组学分析显示，肝癌细胞中与TFAM结合的蛋白显著富集于细胞蛋白翻译及转位、嘌呤和酰胺代谢合成、细胞免疫应答及细胞分化过程相关信号通路。进一步通过免疫共沉淀和免疫印迹分析，证明了肝癌细胞SNU-739中，TFAM与抗沉默功能蛋白1同源物B(ASF1B)、醛脱氢酶1家族成员L1(ALDH1L1)、Ral相互作用蛋白(RBP1)、BRG1相关因子180(PBRM1)、BRG1相关因子170(SMARCC2)存在互作关系。在SNU-739细胞中干涉ASF1B、RBP1、SMARCC2表达可抑制细胞增殖(P<0.01),干涉ALDH1L1和PBRM1表达则促进细胞增殖(P<0.05)。结论 通过初步筛选和鉴定，发现肝癌细胞中的TFAM特异性结合蛋白ASF1B、ALDH1L1、RBP1、PBRM1、SMARCC2可能成为肝癌发生发展过程中的新型生物标志物，并为开发针对性治疗靶点提供了新的研究方向，对改善肝癌患者的诊断治疗及预后具有重要临床意义。

关键词

TFAM结合蛋白 / 4D-FastDIA蛋白组学 / 肝细胞肝癌 / 生物标志物

基金资助

国家自然科学基金(82203509)