基于网络药理学和分子对接技术探讨黄连解毒汤治疗心肌缺血再灌注损伤的分子机制

摘要

目的 运用网络药理学和分子对接技术探讨黄连解毒汤治疗心肌缺血再灌注损伤(MI/RI)的活性成分和潜在作用机制。方法 基于TCMSP和ETCM数据库进行黄连解毒汤化合物筛选，并基于SwissTargetPrediction平台预测候选成分的作用靶标。整合OMIM、GeneCards、CTD、TTD及PharmGKB数据库资源，收集MI/RI相关疾病靶点，借助Venny在线工具提取药物与疾病的共有靶标。最终采用Cytoscape 3.8.0软件构建包含药物分子、活性成分及疾病靶点的三维互作网络模型。使用STRING数据库及Cytoscape 3.8.0构建蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)网络，筛选核心靶点并构建网络图。借助R语言对共同靶点进行GO及KEGG富集分析，并通过AutoDock Vina 1.2.5进行分子对接验证。结果 筛选得出黄连解毒汤中85个活性成分，药物靶点193个，疾病靶点1 817个，共同靶点125个。核心活性成分包括小檗碱、黄芩素等。PPI网络中筛选出7个核心靶点，包括IL-1β、TP53、AKT1、EGFR、JUN、FOS和STAT1。GO分析显示主要涉及氧化应激、炎症反应等生物学过程，KEGG分析显示主要涉及TNF、HIF-1、凋亡、NF-κB和PI3K-Akt信号通路。分子对接结果显示部分活性成分与核心靶点结合能均<-28.45 kJ/mol,结合稳定性较高。结论 黄连解毒汤通过多靶点、多通路的作用机制，减轻MI/RI引起的氧化应激、炎症反应和细胞凋亡，保护心肌细胞。本研究为黄连解毒汤治疗MI/RI的临床应用提供了科学依据，并为进一步的基础研究和临床研究提供了理论基础。

关键词

心肌缺血再灌注损伤 / 黄连解毒汤 / 网络药理学 / 分子对接 / 作用机制 / 活性成分

基金资助

国家自然科学基金(81970245); 空军军医大学“临床医学+药学”创新中心研究专项-重点研发专项(LHJJ2023-YX02)