生物信息学视角揭示PYCR1基因在肿瘤免疫和预后中的作用

摘要

目的 分析泛癌中吡咯啉-5-羧酸还原酶-1(PYCR1)基因的表达及其在肿瘤免疫、预后当中的作用，探讨PYCR1在肿瘤免疫治疗和临床预后中的价值。方法 利用UALCAN、TCGA、GEO和GTEx数据库对PYCR1基因进行差异表达泛癌分析，通过Kaplan-Meier曲线及单因素Cox回归确定与预后的关系；CIBERSORT、ESTIMATE评估与肿瘤免疫浸润的相关性；Spearman分析PYCR1与肿瘤突变负荷、微卫星不稳定及免疫相关基因群的相关性；从KEGG数据库获得免疫相关过程基因群，进行相关性分析；GEO、HPA数据库作为外部队列验证集。结果 PYCR1基因在多种肿瘤中均处于高表达水平，生存分析显示其与多种肿瘤的预后密切相关，其中在ACC、KIRC、KIRP、MESO、PAAD、SARC、SKCM中可以作为显著的危险因素，提示患者的不良预后；免疫浸润提示其在多种肿瘤中与免疫细胞浸润具有相关性，其中巨噬细胞和T细胞亚群与PYCR1表达量相关性最强；PYCR1表达与STES、STAD、LUAD、KIRC、KIPAN 5种肿瘤的突变负荷呈明显相关；PYCR1表达与UCEC、STES、STAD、KICA的微卫星不稳定具有明显相关性；通路富集分析发现PYCR1参与了氨基酸代谢、氧化还原、细胞死亡等多个重要生物学过程；GEO、HPA数据库验证了PYCR1在卵巢癌、宫颈癌、肝细胞癌中的差异表达。结论 PYCR1有望作为泛癌肿瘤标志物，且可用于肿瘤免疫治疗效果评价以及评估肿瘤患者的预后，对临床肿瘤诊断、治疗及预后具有重要意义。

关键词

PYCR1 / 肿瘤免疫 / 预后评估 / 生物信息学 / 泛癌

基金资助

国家自然科学基金(82172993); 陕西省自然科学基础研究项目(2024JC-YBMS-703)