单细胞RNA测序揭示SLC6A6在上皮性卵巢癌细胞中的特异性表达及细胞周期非依赖性特征

摘要

目的 基于单细胞转录组测序数据，解析溶质载体家族6成员6(SLC6A6)在上皮性卵巢癌(EOC)肿瘤微环境中的表达特征与生物学功能。方法 利用来自GEO数据库的EOC单细胞数据集(GSE222556),提取并注释上皮细胞(肿瘤细胞)群体，进一步将其划分为增殖性、非增殖性与IFN反应性功能亚群，以分析SLC6A6在各亚群的表达模式。基于SLC6A6表达水平，将上皮细胞分为高、低表达组，进行差异表达基因分析，并开展GO富集分析、细胞周期评估及临床相关性分析。结果 SLC6A6在EOC肿瘤上皮细胞中呈高表达状态。在肿瘤细胞内部，SLC6A6在增殖性、非增殖性及干扰素反应性亚群中的表达模式相近。GO富集分析显示，SLC6A6高表达相关基因主要富集于上皮细胞增殖与正向调控、细胞间通讯与微环境重塑以及血管生成等生物学过程。细胞周期分析表明，SLC6A6表达水平与细胞周期分布无直接关联。临床相关性分析显示，SLC6A6高表达与晚期FIGO分期、BRCA野生型状态显著相关，且其在原发灶中的表达水平高于转移灶(P<0.01)。结论 SLC6A6在EOC肿瘤微环境的多种细胞类型中均有表达，其高表达参与多个与肿瘤进展相关的生物学过程，提示其可能是EOC中一个具有潜在研究价值的分子。

关键词

溶质载体家族6成员6 / 单细胞分析 / 卵巢肿瘤 / 上皮细胞 / 肿瘤微环境 / 细胞周期 / 生物信息学 / 基因表达调控