APP/PS1转基因小鼠脑组织环状RNA的差异表达谱及相关ceRNA构建

摘要

目的：探讨阿尔茨海默病(AD)模型小鼠脑组织中环状RNA(circRNA)的差异表达谱，构建circRNA-miRNA-mRNA调控网络，明确circRNA在AD发生中的调控机制。方法：采用基因芯片技术检测APP/PS1转基因AD模型小鼠大脑中circRNA的差异表达，对差异circRNA进行基因本体论(GO)和京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路分析，采用实时定量聚合酶链反应验证随机选取的5个差异表达的circRNA,构建circRNA-miRNA-mRNA,进行AD靶基因功能预测分析。结果：共筛选出52个差异表达的circRNA,其中28个上调，24个下调。GO和KEGG的富集分析结果显示，差异表达的circRNA的亲本基因主要参与神经系统发育、蛋白质结合、RNA运输、调控干细胞多能性的信号通路和Hippo信号通路。生物学信息分析成功构建circRNA-miRNA-mRNA的竞争性内源(ceRNA)网络，显示这些靶基因富集的功能可能通过小分子结合、浆膜、cAMP信号通路和Rap1信号通路发挥作用。结论：AD模型小鼠大脑中存在多种差异表达的circRNA,这些差异基因可能通过circRNA-miRNA-mRNA调节网络参与AD发生的分子调控。

关键词

阿尔茨海默病 / 环状RNA / 微小RNA / circRNA-miRNA-mRNA调节网络