基于加权基因共表达网络分析挖掘子宫内膜癌发生发展相关枢纽基因

翟梁好; 计春敏; 董健; 周福兴; 杨红; 陈必良

doi:10.13898/j.cnki.issn.1000-2200.2024.12.002

蚌埠医科大学学报 ›› 2024, Vol. 49 ›› Issue (12) : 1556 -1561. DOI: 10.13898/j.cnki.issn.1000-2200.2024.12.002

基于加权基因共表达网络分析挖掘子宫内膜癌发生发展相关枢纽基因

翟梁好, 计春敏, 董健, 周福兴, 杨红, 陈必良

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摘要

目的：从基因网络层面挖掘与子宫内膜癌(EC)发生发展过程相关的关键模块及枢纽基因。方法：基于癌症基因组图谱计划(TCGA)中的EC的标本数据，从表达水平和功能水平分析EC与正常组织的差异表达基因(DEGs)。利用基因本体(GO)分析进行DEGs的功能富集。使用加权基因共表达网络分析(WGCNA)识别出DEGs中与EC病人临床特征相关的模块，进一步挖掘出与EC发生发展相关性最高的枢纽基因。结果：WGCNA鉴定出8个与EC病人临床特征相关的基因模块，包括与癌症发病相关的黄色和蓝色模块。通过对黄色和蓝色两个枢纽模块的分析和验证，发现了以下8个枢纽基因基因：TTK,IQGAP3,CCNE1,CLEC1A,TSHZ3,TBC1D2B,PEAR1和DIPK2B。结论：WGCNA可以筛选出与EC相关且具有生物学意义的关键模块及枢纽基因，为EC的治疗提供新靶点。