肝细胞癌干性分型及其预后基因GSDMC的研究

摘要

目的：通过肝细胞癌干性分型筛查某些对免疫治疗反应更灵敏的患者，并验证其预后相关基因GSDMC。方法：从StemChecker数据库中提取26个干细胞基因组，采用共识聚类算法对癌症基因组图谱计划数据库中的328个肝细胞癌样本进行干性亚型鉴定。评估两种亚型在预后、肿瘤微环境成分和治疗反应方面的差异。然后，通过加权基因共表达网络分析、Cox回归和随机森林生存分析，筛选预后相关基因。最后，选择预后相关基因GSDMC进行实验验证。结果：根据单样本基因集富集分析，将肝细胞癌患者分为两种亚型（C1和C2）。C1和C2在生存率、免疫浸润水平和治疗反应方面存在显著差异。结合WGCNA,Cox回归和随机森林生存分析确定了4个预后相关基因（GSDMC,AOC1,OTX1,CASC9）。免疫印迹、免疫组织化学和实时荧光定量PCR表明，GSDMC在肝细胞癌组织和细胞中的表达降低。细胞成球实验表明GSDMC抑制肝细胞癌细胞的干性。结论：鉴定两种不同的干细胞亚型C1和C2，为肝细胞癌的临床异质性及其与预后、TME特征和免疫治疗提供了有价值的见解；GSDMC在肝细胞癌组织和细胞中的表达降低，GSDMC抑制肝细胞癌细胞的干性。

关键词

肝细胞癌 / GSDMC / 干性 / 肿瘤微环境 / 免疫治疗

基金资助

安徽省自然科学基金资助项目（2008085J37）