基于生物信息学和临床样本探究FMR1与胃癌的相关性及其在肿瘤微环境中的作用

韩宜倩; 胡楠; 周康杰; 蒋薇薇; 张淼; 毛晨曦; 吴风雷

doi:10.13210/j.cnki.jhmu.20241108.004

海南医科大学学报 ›› 2025, Vol. 31 ›› Issue (09) : 691 -701. DOI: 10.13210/j.cnki.jhmu.20241108.004

基于生物信息学和临床样本探究FMR1与胃癌的相关性及其在肿瘤微环境中的作用

韩宜倩, 胡楠, 周康杰, 蒋薇薇, 张淼, 毛晨曦, 吴风雷

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摘要

目的：本研究旨在分析脆性X智力低下1(Fragile X Mental Retardation 1,FMR1)基因在胃癌（gastric cancer, GC）和相邻非癌组织中表达的差异，并探讨其与胃癌患者临床病理特征和预后的相关性，分析了其可能调控的信号通路和在肿瘤微环境中的作用。方法：利用TIMER2.0工具对FMR1进行泛癌分析。利用癌症基因组图谱（the cancer genome atlas, TCGA）数据库探讨FMR1基因在胃癌及正常胃上皮组织中的表达差异情况，并使用qRT-PCR、免疫组化等对结果进行验证。采用Kaplan-Meier Plottery数据库进行生存分析。使用R软件及临床样本评估胃癌患者中FMR1表达水平与临床病理因素的相关性。通过TISIDB数据库分析FMR1与胃癌肿瘤免疫浸润之间的关系。通过功能注释工具分析FMR1及其互作基因的功能。结果：FMR1在胃癌中的阳性表达率显著高于正常胃组织（P<0.001）;FMR1高表达的胃癌患者总体生存时间显著降低（P<0.05）；胃癌患者中FMR1的不同表达情况与其肿瘤微环境中多种免疫细胞的活动相关（P<0.05）; FMR1可能参与角蛋白丝、门控通道活动等过程，并与嗅觉传导、非洲锥虫病、过氧化物酶体增殖物激活受体（peroxisome proliferator-activated receptor,PPAR）等通路相关；生物信息学和临床样本分析结果表明FMR1的表达水平与胃癌患者的分期密切相关（P<0.05）。结论：FMR1基因高水平表达与胃癌患者的不良预后和免疫细胞浸润状况密切相关，其有望被确立为一种用于胃癌诊断和治疗的新型生物标志物。