基于转录组测序探讨光动力疗法对人牙周炎性组织mRNA表达谱的影响

摘要

目的：基于转录组测序探究光动力疗法（photodynamic therapy,PDT）对人牙周炎性组织基因表达的影响，分析关键差异表达基因（differentially expressed genes,DEGs），并探寻PDT的潜在机制。方法：临床收集健康牙周组织、牙周炎性组织和PDT治疗后牙周炎性组织各5例，进行转录组测序，并利用生物信息学分析进行枢纽基因筛选及富集分析。每组再收集15例组织，利用RT-qPCR法验证测序结果。结果：健康牙周组织和牙周炎性组织之间共检测出6 526个DEGs，牙周炎性组织和PDT治疗后牙周炎性组织之间共检测出1 209个DEGs，筛选出72个免疫相关差异基因，GO富集分析包括白细胞迁移、对细菌的防御反应等生物学过程；KEGG通路分析主要涉及细胞因子-细胞因子受体相互作用、JAK-STAT信号通路、IL-17信号通路等通路。构建PPI网络并筛选出6个枢纽基因（S100A7、LCN2、LTF、DEFB4A、S100A12、S100A8）,RT-qPCR验证结果与测序结果一致。结论：本研究确定了PDT治疗后人牙周炎性组织mRNA的表达谱，鉴定相关枢纽基因及功能分析，为探讨PDT调控牙周炎性组织的潜在机制提供参考。

关键词

牙周炎 / 光动力疗法 / 转录组测序 / 牙周炎性组织