哮喘中代谢相关的“lncRNA-miRNA-mRNA”ceRNA网络构建

摘要

目的：构建一个竞争性内源性RNA(ceRNA)网络，以丰富哮喘的分子机制，探索新的治疗靶点。方法：通过基因表达综合数据库获取了与哮喘相关的基因表达数据，并进行了差异表达分析。利用加权基因共表达网络分析（WGCNA）方法构建了共表达网络，识别出与哮喘相关的基因模块。通过基因集富集分析和差异表达分析，筛选出关键基因，利用miRDB、TargetScan和starBase3.0在线数据库预测关键基因靶向的microRNA。同时，通过LncBase和ENCORI平台预测了microRNA与lncRNA之间的相互作用。排除了仅在细胞核和细胞外间隙中的lncRNA后，利用Cytoscape构建了ceRNA网络。通过实时荧光定量PCR验证ceRNA网络中关键因子的表达模式。结果：基因集富集分析显示与哮喘相关的差异表达基因主要集中于代谢通路。WGCNA和差异表达分析筛选出关键基因NADK。结合在线数据库和生物信息学算法构建了ceRNA网络“NADK-hsa-miR-214-3p-EPB41L4A-AS1”。qRT-PCR结果显示在人气道上皮细胞系中构建的哮喘细胞模型中NADK和EPB41L‑AS1的表达水平明显上升，而miR‑214‑3p的表达水平明显下降。结论：“NADK-hsa-miR-214-3p-EPB41L4A-AS1”网络可能在在哮喘中起着潜在调控作用。本研究的发现可能为哮喘的早期诊断、病情监测和预后评估提供新的生物标志物。

关键词

哮喘 / 竞争性内源性RNA / 代谢 / NAD激酶 / lncRNA