链格孢菌橘致病型侵染柑橘抗感品种的转录组差异表达分析

摘要

为探究柑橘褐斑病致病菌链格孢菌橘致病型（the tangerine pathotype of Alternaria alternata）在侵染柑橘抗感品种过程中的基因表达差异，利用其菌丝球分别侵染感病品种红橘和抗病品种纽荷尔脐橙后，采用高通量测序技术对病原菌菌丝阶段（0 h）及3个侵染时期（接种后12、24和48 h）的样品进行转录组测序与组装，并进行功能注释与分类、差异基因筛选与分析。结果显示：链格孢菌橘致病型侵染感病品种红橘后其特异性差异表达基因的功能主要富集于细胞能量代谢、氨基酸和辅酶的合成与分解以及果胶的降解过程，该菌侵染抗病品种纽荷尔脐橙后其特异性差异表达基因的功能主要富集于细胞结构构建、细胞通信以及环境应激和响应，说明链格孢菌橘致病型侵染红橘和纽荷尔脐橙时所激活的生物反应和代谢途径不同。将该菌接种于红橘离体叶片后，其通过协同调控毒力、代谢及生长发育等过程主动侵染寄主，抑制寄主防御反应，实现在寄主体内的高效寄生适应；而将其接种于纽荷尔脐橙离体叶片后，病原菌与寄主的防御系统一直呈现博弈的状态，该菌也因寄主持续的防御干扰导致其一直未能完全瓦解寄主抗性，致使无法成功侵染定殖。实时荧光定量PCR验证结果与转录组测序结果一致，表明转录组测序数据可靠。

关键词

链格孢菌橘致病型 / 抗感品种 / 转录组 / 差异表达基因