ITS序列在天门冬属物种DNA条形码构建中的应用研究

蒋向辉, 曾桂萍, 欧立军, 佘朝文, 许栋

华中师范大学学报(自然科学版) ›› 2011, Vol. 45 ›› Issue (03) : 472 -476.

华中师范大学学报(自然科学版) ›› 2011, Vol. 45 ›› Issue (03) : 472 -476. DOI: 10.19603/j.cnki.1000-1190.2011.03.026

ITS序列在天门冬属物种DNA条形码构建中的应用研究

    蒋向辉, 曾桂萍, 欧立军, 佘朝文, 许栋
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摘要

在对天门冬属4个种ITS(internal transcribed spacer)序列克隆测序的基础上,并对4个种进行序列比较分析.结果表明:(1)4个物种的亲缘关系很近,它们间的ITS序列的变异小,GC含量高,在60%左右.(2)4个物种在系统树上聚为一类,文竹与其他3种天门冬的亲缘关系相对较远,处于系统树的一支,其中,非洲天门冬与新疆天门冬的亲缘关系较近,处于系统树的一支.(3)ITS序列的种间差异值略有不相,短梗天门冬与非洲天门冬的差异值为2.8%,与新疆天门冬的差异值为3.5%,与文竹的差异值为8.5%,非洲天门冬与新疆天门冬的差异值为2.1%,与文竹的差异值为8.3%,新疆天门冬与文竹的差异值为9.1%.综合分析认为:以ITS序列为DNA条形码可真实反应天门冬属物种间差异.

关键词

ITS序列 / 天门冬属 / DNA条形码

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蒋向辉, 曾桂萍, 欧立军, 佘朝文, 许栋. ITS序列在天门冬属物种DNA条形码构建中的应用研究[J]. 华中师范大学学报(自然科学版), 2011, 45(03): 472-476 DOI:10.19603/j.cnki.1000-1190.2011.03.026

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贵州省中药现代化研究开发专项项目(黔科合农字[2006]5029号); 湖南省科研计划重点资助项目(2009FJ2008); 湖南省教育厅资助项目(09C755);湖南省教育厅重点实验室平台项目

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