大肠杆菌酶基因缺失菌株碳中心代谢系统的代谢通量分析

芮斌; 金杰军; 范亚东; 文汉

doi:10.19603/j.cnki.1000-1190.2014.02.019

华中师范大学学报（自然科学版） ›› 2014, Vol. 48 ›› Issue (02) : 251 -256. DOI: 10.19603/j.cnki.1000-1190.2014.02.019

大肠杆菌酶基因缺失菌株碳中心代谢系统的代谢通量分析

芮斌, 金杰军, 范亚东, 文汉

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摘要

大肠杆菌(E.coli)因其遗传信息简单且容易培养而被广泛用作各种生物化学、生物技术研究的模式微生物.为了认识重要模式生物大肠杆菌的代谢系统中各种酶的作用,以软件分析的模式,对已经构建好的小型大肠杆菌代谢系统在cobra中进行代谢通量平衡分析FBA(Flux-Balance Analysis)和代谢通量变化性分析FVA(Flux Variability Analysis),分别单独敲除代谢系统中的25个酶基因,分析敲除各个酶基因后的FBA和FVA的计算结果,通过作图显示出在大肠杆菌代谢系统中不同酶基因被敲除后每个反应的两项结果变化和不同酶基因被敲除后全部反应的两项结果的变化,以此来推测大肠杆菌代谢系统中各种酶所起的作用.