miR-1/133基因簇的进化及其调控网络

陈怡香; 岳虎; 张超文; 刘杰

doi:10.19603/j.cnki.1000-1190.2018.02.013

华中师范大学学报（自然科学版） ›› 2018, Vol. 52 ›› Issue (02) : 231 -239. DOI: 10.19603/j.cnki.1000-1190.2018.02.013

miR-1/133基因簇的进化及其调控网络

陈怡香, 岳虎, 张超文, 刘杰

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摘要

miR-1/133基因簇在心肌和骨骼肌中特异性表达,对心脏以及骨骼肌的发育及生理病理具有重要作用.该研究采用生物信息学方法,研究了miR-1/133基因簇的进化特征,预测了其靶基因及其调控的生物学过程.利用miRBase数据库对23种不同物种间miR-1/133基因簇的序列、组织方式进行了比较.采用最大似然法构建miR-1/133基因簇的系统进化树,显示该基因簇的进化与物种进化关系有一定差异.利用在线数据库对miR-1/133基因簇上游转录因子及下游靶基因进行预测,并对其进行综合分析,绘制出该基因簇的网络调控图,表明miR-1/133基因簇参与了骨骼肌与心肌发育、胰岛素受体信号通路、经典Wnt信号通路、p53信号通路等体内重要生理过程,为进一步阐明miR-1/133基因簇的生物学功能提供了理论依据.