淡水养殖水体细菌群落结构与硝化速率的关系

摘要

为研究3类淡水养殖水体(精养虾蟹池、湖泊养殖水体和精养鱼池)细菌群落结构与硝化速率的关系，通过16S rRNA基因高通量测序与流式细胞仪分析了15个养殖水体的细菌种群结构和总菌数，并测定了硝化速率.结果表明：淡水养殖水体中的优势菌群门为变形菌门(Proteobacteria)、放线菌门(Acidobacteria)和拟杆菌门(Bacteroidetes),且夏季细菌群落的多样性显著高于春季(p<0.05).春季的亚硝酸盐氧化细菌(NOB)为Nitrotoga和硝化杆菌(Nitrobacter),其中硝化杆菌的丰度与硝化速率呈显著正相关(p<0.05),且精养鱼池中NOB的丰度显著高于另两类型水体(p<0.05);夏季NOB以硝化螺菌(Nitrospira)为主，其丰度也与硝化速率显著正相关(p<0.05),且湖泊散养水体中NOB的丰度显著高于另两类水体(p<0.05).此外，春夏两季的黄单胞菌目(Xanthomonadales)的丰度均与硝化速率显著正相关.上述结果说明，养殖水中NOB的分布受季节和养殖水体类型的影响，而硝化速率则受多种细菌的共同影响.

关键词

高通量测序 / 淡水养殖 / 细菌多样性 / 硝化速率