苹果NCED基因家族鉴定及表达分析

摘要

植物在应对非生物胁迫时，脱落酸（ABA）发挥着关键的调节作用。生物体合成ABA的过程中9-顺式-环氧类胡萝卜素加双氧酶蛋白（9-cis-epoxycarotenoids dioxygenase,NCED）具有重要调控作用。本研究通过生物信息学方法开展苹果NCED基因家族成员鉴定，进而通过表达图谱分析了在干旱和盐胁迫条件下苹果MdNCEDs基因的表达情况。结果表明，本研究鉴定得到MdNCED基因家族成员18个，染色体定位分析显示18个MdNCEDs分布在10条染色体上；理化性质分析显示MdNCEDs分子量为46.47-76.36 kD，等电点介于5.2-7.63之间。苹果MdNCED启动子序列中检测到多种与逆境激素、响应非生物胁迫反应功能元件；基因结构分析显示，MdNCED基因结构有较高一致性；共线性分析结果显示，部分基因之间发生了复制事件；苹果MdNCEDs基因响应干旱、高盐胁迫的表达数据显示，与CK(0 h)相比，在高盐和干旱两种非生物胁迫处理下3个基因（MdMYB3、MdMYB11、MdMYB18）上调表达，4个基因（MdMYB1、MdMYB6、MdMYB13、MdMYB17）下调表达，2个基因（MdMYB4、MdMYB14）表达无明显规律，4个基因（MdMYB5,MdMYB8,MdMYB9,MdMYB16）无显著性差异。本文为后续深入解析苹果MdNCEDs基因的功能提供了基础理论依据。

关键词

苹果 / 脱落酸 / NCED基因家族 / 生物信息学分析