IQGAP3在宫颈癌中的表达及其对患者预后和免疫浸润的影响

摘要

目的 探讨在宫颈癌中IQ结构域GTP酶激活蛋白3(IQ motif-containing GTPase activating protein 3, IQGAP3)的表达水平及其与患者预后、免疫浸润水平和生物学功能之间的关系。方法 使用基因表达谱交互式分析（Gene Expression Profiling Interactive Analysis, GEPIA）数据库分析宫颈癌组织和正常对照组织中IQGAP3 mRNA的表达水平。利用人类蛋白质图谱（Human Protein Atlas, HPA）数据库提供的免疫组化切片探索了IQGAP3蛋白在宫颈癌组织及正常对照组织中的表达情况。采用免疫组化检测宫颈癌组织芯片中IQGAP3蛋白表达，并采用Kaplan-Meier法绘制生存曲线。从癌症基因组图谱（The Cancer Genome Atlas, TCGA）数据库获得了306例宫颈癌的RNAseq数据以及相应的临床信息，对IQGAP3相关的差异基因进行了富集分析，包括基因本体论（gene ontology,GO）和京都基因和基因组百科全书（Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes,KEGG）富集分析。采用EPIC算法对宫颈癌组织中免疫细胞的浸润情况进行分析，并分析IQGAP3高表达组和低表达组免疫检查点相关基因的表达情况。结果 与正常对照组织比较，宫颈癌组织中IQGAP3的mRNA及蛋白高表达（P<0.05）。Kaplan-Meier生存曲线分析显示，IQGAP3蛋白高表达组宫颈癌患者总生存期及无进展生存期明显降低（P<0.05）,IQGAP3表达水平的升高与淋巴结转移、较高的T分期及复发之间存在明显的相关性（P<0.05）。通过富集分析发现，IQGAP3可能参与间隙连接、铁死亡、Hippo信号通路的负调控等信号通路及生物学过程。此外，IQGAP3的表达与CD4+T细胞、巨噬细胞和NK细胞类型有关，在IQGAP3高表达组中，部分免疫检查点相关基因（CTLA4、HAVCR2、LAG3）的表达显著下调。结论 IQGAP3在宫颈癌中高表达，与患者的预后和免疫特征相关。

关键词

宫颈癌 / IQGAP3 / 生物信息学 / 预后 / 免疫浸润