XIST和TSIX lncRNA在缺血性脑卒中中的作用及其机制

摘要

目的 通过对缺血性脑卒中患者外周血单个核细胞（PBMC）进行RNA-seq测序，探究缺血性脑卒中潜在的lncRNA生物学靶点。方法 分别收集10例缺血性脑卒中患者（缺血性脑卒中组）和10例健康对照者（对照组）的新鲜全血样本，所有血液样本均使用抗凝管采集，提取PBMC的RNA，使用String Tie处理转录本进行筛选和过滤，DESeq2获取差异表达的lncRNA，实时荧光定量逆转录聚合酶链式反应（qRT-PCR）验证lncRNA生物学靶点在缺血性脑卒中患者PBMC中mRNA的表达情况。采用京都基因与基因组百科全书（KEGG）富集分析对lncRNA反式调控及lncRNA顺式调控潜在通路进行探索。结果 通过对候选lncRNA进行筛选，缺血性脑卒中组与对照组共获得1 391个表达转录本。采用DESeq2进行差异表达分析，共鉴定出408个显著差异表达的lncRNA，其中262个显著上调，146个显著下调。通过对测序结果的深入分析，确定lncRNA XIST和TSIX为缺血性脑卒中潜在的新型生物学靶点。与对照组相比，缺血性脑卒中组中XIST的mRNA表达水平下降，而TSIX的mRNA表达水平升高（均P<0.05）。进一步对差异表达的lncRNA与mRNA进行共表达分析发现，反式调控的差异lncRNA在分子功能上主要富集于蛋白结合，在生物过程中核心调控细胞黏附，且这些功能与细胞外囊泡密切相关。顺式调控的lncRNA则主要参与蛋白结合，在生物过程中以免疫反应为核心，且多位于细胞膜。KEGG通路富集分析表明，这两类调控方式均显著富集于细胞外基质-受体相互作用通路。结论 XIST和TSIX lncRNA可能为缺血性脑卒中临床诊断的生物学标志物，通过调控细胞外基质-受体相互作用通路诱导缺血性脑卒中。

关键词

缺血性脑卒中 / lncRNA / 转录组测序 / 生物标志物 / XIST / TSIX