基于多组学整合分析瞬时受体电位通道在肝癌发生发展中的分子分型及机制

摘要

目的 探究瞬时受体电位（TRP）通道在肝细胞癌（HCC）发生发展中的生物学机制及治疗潜力。方法 整合TCGA、MsigDB、KEGG和Genecards数据库筛选TRP通道差异基因，结合无监督聚类鉴定分子亚型。采用单变量Cox和LASSO回归构建HCC预后模型，经Bootstrap重抽样（1 000次）及外部队列验证。通过CIBERSORT算法评估免疫细胞浸润程度，并分析TRP预后风险评分（TRPRS）与免疫检查点分子表达的相关性。结合药物敏感性预测和拷贝数变异分析，评估预后模型临床关联性。通过qRT-PCR检测关键基因（GHR, KCNJ11）在肝癌细胞系MHCC-97H和正常肝细胞LO2中mRNA转录水平，考马斯亮蓝染色法检测其蛋白表达水平，以验证关键基因在肝癌细胞中的表达变化。结果 共鉴定出93个TRP通道差异基因，基于无监督聚类将其划分为2种分子亚型（cluster 1与cluster 2）。通过LASSO-Cox回归筛选核心基因GHR和KCNJ11构建预后模型，内外部队列的ROC曲线证实了该模型的可靠性（在TCGA＿HCC训练集中AUC>0.7,P=0.000 14）。多因素Cox分析显示，TRPRS是HCC患者在TCGA＿HCC(P<0.001)、GSE76427(P=0.045)和LIRI-JP(P=0.03)队列中的独立预后因素；免疫浸润与免疫检查点分析显示TRPRS与免疫微环境特征相关，与免疫检查点CTLA4表达正相关，与CD274表达负相关（均P<0.05）；药物敏感性分析表明，高TRPRS组对顺铂等化疗药物敏感性增强（P<0.001），且高TRPRS组TIDE评分更高（P=0.006 7）。qRT-PCR和考马斯亮蓝染色结果显示，GHR和KCNJ11在肝癌细胞系MHCC-97H中的mRNA（均P<0.001）及总蛋白表达均显著高于正常肝细胞LO2。结论 TRP通路因子GHR和KCNJ11通过调控免疫微环境和药物敏感性参与肝癌进展，为HCC机制研究及治疗靶点筛选提供依据。

关键词

TRP通道 / 分子亚型 / 预后模型 / 肝细胞癌 / 免疫浸润 / 生物标志物