三浅裂野牵牛SnRK2基因家族的鉴定和表达分析

摘要

蔗糖非酵解型蛋白激酶SnRK可分为SnRK1、SnRK2和SnRK3共3个亚族，其中，SnRK2是一类仅存在于植物中的蛋白激酶，已在多种植物中得到了鉴定，其在植物生长发育、胁迫响应和信号转导中发挥了重要作用。为探究三浅裂野牵牛中SnRK2基因家族的成员并推测其功能，利用拟南芥SnRK2蛋白序列，通过生物信息学方法筛选并鉴定ItfSnRK2基因家族成员，对各成员的特征进行分析，采用转录组数据分析ItfSnRK2各成员在不同组织和非生物胁迫下的表达谱。结果发现，三浅裂野牵牛中共有7个ItfSnRK2基因，分别位于6条不同的染色体上，依据染色体排列顺序依次命名为ItfSnRK2.1～ItfSnRK2.7，它们均含有保守的激酶结构域和调节结构域。进化树分析结果显示，ItfSnRK2分为3个亚家族。基因结构分析显示，同一亚家族的成员具有相似的基因结构和保守基序组成。表达谱分析则揭示了ItfSnRK2基因具有组织表达的特异性，ItfSnRK2.2、ItfSnRK2.3、ItfSnRK2.4和ItfSnRK2.5的表达受非生物胁迫诱导，可能与抗性调节有关，以上结果为进一步了解SnRK2基因在甘薯逆境胁迫响应和信号转导中的具体功能提供了重要线索，也为甘薯的抗逆性改良提供了潜在的基因资源。

关键词

三浅裂野牵牛 / SnRK2基因家族鉴定 / 生物信息学分析