阔叶十大功劳治疗肝癌作用机制的生物信息学研究

摘要

基于网络药理学和生物信息学探讨了阔叶十大功劳（Mahonia bealei (Fort.) Carr, MB）治疗肝癌的作用机制.首先，利用中药系统药理学数据库与分析平台（TCMSP）数据库获取MB的靶点，并通过基因表达综合数据库（GEO）数据库下载肝癌数据集GSE45267.使用Cytoscape软件和STRING数据库构建蛋白互作网络，并通过David数据库进行基因本体论（GO）和京都基因与基因组（KEGG）富集分析.此外，运用GEPIA、THPA、UALCAN和KaplanMeier等数据库进行差异表达、蛋白分析、临床相关性和生存分析，最后通过DS BIOVIA Discovery Studio 2016 v16.1软件进行分子对接.研究筛选出8个hub基因（CCNB1、CCNB2、AURKA、CCNA2、CCNE1、CHEK1、CDK1、TOP2A），这些基因在肝癌组织中显著高表达.生存分析表明，这8个基因与总生存期和无进展生存期显著相关.分子对接结果表明，7个蛋白（CCNB1、AURKA、CCNA2、CCNE1、CHEK1、CDK1、TOP2A）可与MB的成分进行结合.综合网络药理学和生物信息学分析，发现MB通过多个成分、靶点和通路协同作用，可能对肝癌具有治疗潜力.

关键词

网络药理学 / 生物信息学 / 阔叶十大功劳 / 肝癌 / 作用机制

基金资助

国家自然科学基金（82060797）; 贵州中医药大学大学生创新创业训练计划项目（贵中医大创合字（2022）135号）