西瓜NPR基因家族的鉴定及其在盐胁迫下的表达分析

摘要

以拟南芥NPR基因家族成员蛋白序列为查询序列，在西瓜基因组数据库中鉴定西瓜NPR基因家族成员，并对其进行生物信息学分析及盐胁迫下的表达分析。共鉴定到4个成员，将其命名为ClNPR1～ClNPR4，其编码蛋白的理化性质、保守功能结构域、重要氨基酸残基及motif分析结果与其他物种有较高的一致性，顺式作用元件分析显示，ClNPRs与非生物胁迫相关。300 mmol·L^-1NaCl处理耐盐材料和盐敏感材料，分别取盐胁迫0、8、24 h的叶片进行4个NPR基因的表达模式分析，结果表明，ClNPR1在盐敏感和耐盐材料中都显著上调表达，但盐胁迫24 h,ClNPR1在盐敏感材料中显著下调表达，在耐盐材料中虽然下调但还保持较高的表达水平，且在耐盐材料中的表达量显著高于盐敏感材料；盐胁迫24 h,ClNPR2和ClNPR3在盐敏感和耐盐材料中都显著上调表达，在耐盐材料中的表达量均显著高于盐敏感材料。推测ClNPRs基因在西瓜响应盐胁迫的过程中扮演重要角色。

关键词

西瓜 / NPR家族蛋白 / 盐胁迫 / 表达

基金资助

黑龙江省重点研发计划（SC2022ZX02C0202）; 国家西甜瓜产业技术体系哈尔滨综合试验站（CARS-25）; 黑龙江省西甜瓜现代农业产业技术协同创新推广体系项目; 黑龙江省农业科技创新跨越工程项目（CX23GG05）