辣椒BAM家族基因鉴定及表达模式分析

李宁; 尹延旭; 高升华; 王畅; 葛长军; 谢勇; 王飞; 姚明华

doi:10.16861/j.cnki.zggc.2025.0347

中国瓜菜 ›› 2025, Vol. 38 ›› Issue (11) : 13 -25. DOI: 10.16861/j.cnki.zggc.2025.0347

辣椒BAM家族基因鉴定及表达模式分析

李宁, 尹延旭, 高升华, 王畅, 葛长军, 谢勇, 王飞, 姚明华

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摘要

β-淀粉酶（BAM）家族基因广泛存在于多种植物中，在植物生长、非生物胁迫响应等方面发挥重要作用。为进一步挖掘辣椒BAM家族成员信息，探究分析其表达模式及基因功能，利用生物信息学手段对辣椒CaBAM基因家族进行全基因组鉴定，并对基因结构、系统进化及表达模式进行分析。结果表明，辣椒中共有10个CaBAM基因，均为亲水性蛋白，分布于细胞核、细胞质、线粒体、叶绿体和质膜中。系统发育分析将CaBAM基因家族划分为6个组，催化残基Glu-186和Glu-380的保守性高于Flexible loop和Inner loop。CaBAM基因启动子区含有多个与逆境、发育等相关的顺式作用元件，转录组和在低温胁迫下的qRT-PCR验证试验分析表明，CaBAM基因在不同组织和非生物胁迫下存在差异表达，CaBAM4、CaBAM5和CaBAM6可能在辣椒生长发育及逆境胁迫中发挥作用。研究结果为进一步深入研究辣椒CaBAM基因家族功能提供了参考。