基于生物信息学分析CCND2在甲状腺乳头状癌中的表达及其对免疫浸润的影响

摘要

目的 探讨凋亡相关基因细胞周期蛋白D2（CCND2）在甲状腺乳头状癌中的表达及其与临床病理的联系。方法 通过公共数据库TCGA、TIMER 2.0和UALCAN获取CCND2的表达情况；采用ROC曲线对甲状腺乳头状癌（PTC）组织和癌旁组织进行鉴别；使用基因本体功能注释（GO）对CCND2相关差异基因（DEGs）进行富集分析；使用TIMER数据库和CIBERSORT数据源分析甲状腺癌中CCND2的肿瘤免疫浸润情况；采用RT-qPCR和Western blot检测人甲状腺正常细胞系Nthy-ori-3-1和人甲状腺乳头状癌细胞系TPC-1、BCPAP中CCND2表达量；采用免疫组织化学SABC法检测PTC及癌旁组织中CCND2表达，并探讨其与临床病理的联系。结果 TCGA、TIMER2.0、UALCAN分析显示，与癌旁组织相比，CCND2 mRNA在甲状腺癌中高表达（P<0.001），并且与Stage分期、性别、年龄、病理亚型及区域淋巴结受累情况有关（P<0.05）;ROC结果显示，截断值为4.983时，CCND2的灵敏度、特异度和准确度分别为83.6%、94.9%和78.5%;GO分析表明CCND2的差异表达与免疫功能有关；TIMER数据库显示，CCND2表达与B细胞、CD4⁺T细胞、巨噬细胞呈正相关（partial.cor>0,P<0.001），而与CD8⁺T细胞呈负相关（partial.cor<0,P<0.01）。CIBERSORT数据库显示，CCND2表达与B细胞记忆渗透水平、CD4⁺T细胞记忆激活状态、M2巨噬细胞表达水平、肥大细胞静息状态和肥大细胞激活状态显著相关（P<0.05）。RT-qPCR及Western blot结果显示，CCND2在细胞系TPC-1、BCPAP中的表达量高于Nthy-ori-3-1（P<0.01）。免疫组织化学结果显示，CCND2在PTC中的阳性表达高于癌旁组织（P<0.05）且与肿瘤大小、淋巴结转移及TNM分期相关（P<0.05）。结论 PTC中CCND2表达上调可能与肿瘤进展及免疫细胞浸润密切相关。

关键词

甲状腺乳头状癌 / 细胞周期蛋白D2 / 生物信息学 / 肿瘤免疫浸润