葡萄座腔菌Botryosphaeria dothidea胞内miRNA及siRNA的鉴定与分析

章鹏程; 俞沁如; 刘瑶瑶; 王寒怡; 胡奕然; 赖童飞; 周婷

doi:10.19926/j.cnki.issn.1674-232X.2023.02.007

杭州师范大学学报（自然科学版） ›› 2023, Vol. 22 ›› Issue (2) : 158 -166. DOI: 10.19926/j.cnki.issn.1674-232X.2023.02.007

葡萄座腔菌Botryosphaeria dothidea胞内miRNA及siRNA的鉴定与分析

章鹏程, 俞沁如, 刘瑶瑶, 王寒怡, 胡奕然, 赖童飞, 周婷

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摘要

通过ITS-rDNA检测和形态学典型特征观察确定葡萄座腔菌Botryosphaeria dothidea的遗传背景，并对其胞内小RNA测序.新预测10个miRNAs和298个siRNAs,并分析了预测的miRNAs和siRNAs的序列信息、结构、长度分布、碱基偏好性、表达情况，为在分子水平了解葡萄座腔菌发育和致病机制提供了理论基础.