大花红景天CBF家族生物信息学分析

徐元江; 彭诗原; 权红; 兰小中; 郑维列

doi:10.19707/j.cnki.jpa.2020.03.001

高原农业 ›› 2020, Vol. 4 ›› Issue (03) : 219 -225+248. DOI: 10.19707/j.cnki.jpa.2020.03.001

大花红景天CBF家族生物信息学分析

徐元江, 彭诗原, 权红, 兰小中, 郑维列

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摘要

CBF (CRT/DRE-binding factor)是低温响应转录因子,可增强抗寒基因的表达,从而提高植物抗寒性。为探究大花红景天CBF家族转录因子的结构与功能,本研究利用生物信息学手段从转录组数据库中筛选出7条RcCBF基因,并系统地分析了该基因家族各蛋白的理化性质、导肽、信号肽、亚细胞定位、跨膜结构、磷酸化与糖基化、系统进化、多重比对等。分析发现7个RcCBF为亲水的酸性蛋白,无跨膜结构,定位于细胞核或细胞质,包含2个CBF家族基因保守元件。该研究可为今后进一步解析RcCBF基因功能提供参考。