猪TPM3基因多态性与表达差异关联分析

邢璐; 梁馨文; 董世雄; 罗布白珍; 商鹏

doi:10.19707/j.cnki.jpa.2021.05.007

高原农业 ›› 2021, Vol. 5 ›› Issue (05) : 479 -484. DOI: 10.19707/j.cnki.jpa.2021.05.007

猪TPM3基因多态性与表达差异关联分析

邢璐, 梁馨文, 董世雄, 罗布白珍, 商鹏

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摘要

为探究TPM3基因在猪肌肉生长中所发挥的作用,本试验对30、90、180日龄的藏猪和大约克猪的背最长肌和腿肌组织进行了RT-qPCR检测,并在DNA水平上对藏猪和大约克猪TPM3基因起始密码子上游3000bp左右的序列进行了单核苷酸多态性(SNPs)位点的筛选。结果发现:在藏猪和大约克猪背最长肌组织中,TPM3基因的mRNA相对表达量随日龄的增长呈现由高到低的趋势,且在30、90日龄中,两猪种间mRNA相对表达量呈藏猪极显著高于大约克猪的趋势(P <0.01);在藏猪和大约克猪腿肌组织中,藏猪TPM3基因的mRNA相对表达量随日龄增长呈现"高-低-高"的趋势,而大约克猪则呈现由低到高的趋势。且在180日龄中,藏猪和大约克猪均趋于平稳并无显著差异(P>0.05)。并且,在TPM3基因起始密码子上游3000 bp左右的序列中,存在A-2115G、G-1866A、C-1788T、C-1595T、A-1563G、A-1538C六个突变位点,并呈连锁趋势。综上所述,上述六个连锁突变位点可能影响藏猪和大约克猪的肌肉生长发育,是调控TPM3基因表达的关键功能位点,本研究对开展猪肌肉性状研究奠定了基础,为藏猪、大约克猪的选育提供了理论依据。