西藏牦牛源多杀性巴氏杆菌OmpH基因的遗传进化、分子特征和抗原性分析

李义兴; 孟朝轶; 符汉宇; 王运路; 刘博华; 徐业芬; 包玉花; 牛家强; 索朗斯珠

doi:10.19707/j.cnki.jpa.2023.01.006

高原农业 ›› 2023, Vol. 7 ›› Issue (01) : 40 -49. DOI: 10.19707/j.cnki.jpa.2023.01.006

西藏牦牛源多杀性巴氏杆菌OmpH基因的遗传进化、分子特征和抗原性分析

李义兴, 孟朝轶, 符汉宇, 王运路, 刘博华, 徐业芬, 包玉花, 牛家强, 索朗斯珠

作者信息 +

Author information +

文章历史 +

PDF (1023K)

摘要

本研究旨在分析一株西藏牦牛源多杀性巴氏杆菌OmpH基因的遗传进化、分子特征和抗原性。从一株西藏牦牛源B型多杀性巴氏杆菌的全基因组测序中获得OmpH基因序列，对其核苷酸序列进行遗传进化分析，通过生物信息学软件在线对OmpH基因编码的氨基酸序列进行理论分子质量、理论等电点、亲水性和疏水性、跨膜结构、结构域、二、三级结构及抗原性分析。结果表明OmpH基因全长1 002 bp，编码333个氨基酸；遗传进化分析发现，西藏牦牛源Pm的OmpH基因与新疆牦牛源的同源性最近。OmpH蛋白的分子特性分析发现该蛋白为亲水性蛋白，较为稳定，具有信号肽结构，所有序列均在膜外，无跨膜结构，属于分泌型蛋白，在PFAM数据库中存在Porin＿1结构域及低复杂性区域；该蛋白的二、三级蛋白结构分析发现分子同源三聚体构成，其中无规则卷曲占比45.35%，结构较为稳定。抗原性分析OmpH蛋白的保护性抗原的总体预测为0.6945，高出正常阈值0.2945。OmpH具有抗原性的可能性较大，可作为免疫原性蛋白和多杀性巴氏杆菌疫苗的较佳候选抗原。