基于蛋白质相互作用网络局部相似度的肝癌疾病基因预测

胡静波, 项炬, 胡涛, 胡柯

湘潭大学学报(自然科学版) ›› 2021, Vol. 43 ›› Issue (01) : 28 -34.

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湘潭大学学报(自然科学版) ›› 2021, Vol. 43 ›› Issue (01) : 28 -34. DOI: 10.13715/j.cnki.nsjxu.2021.01.004

基于蛋白质相互作用网络局部相似度的肝癌疾病基因预测

    胡静波, 项炬, 胡涛, 胡柯
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摘要

基于人类蛋白质相互作用网络,该文采纳拓扑局部相似度去实现肝癌疾病基因的预测.交叉检验测试结果表明:有22%~29%的目标基因在候选基因中排名前5%,且预测精度均能达到0.7以上.归因于低的计算复杂度和相对高的预测精度,这类疾病基因预测方法可为发现和鉴定疾病基因提供有力的线索.

关键词

局部相似性指标 / 肝癌疾病基因 / 蛋白质相互作用网络 / 疾病基因预测

Key words

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基于蛋白质相互作用网络局部相似度的肝癌疾病基因预测[J]. 湘潭大学学报(自然科学版), 2021, 43(01): 28-34 DOI:10.13715/j.cnki.nsjxu.2021.01.004

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