基于生物信息学分析泛凋亡基因对胃癌预后及肿瘤免疫微环境的影响

摘要

目的 探讨泛凋亡相关基因对胃癌患者预后及免疫微环境的预测价值。方法 基于TCGA、GEO数据库中胃癌患者PANoptosis差异基因表达谱，对胃癌患者进行聚类分析并构建预测模型，分析不同胃癌患者PANoptosis亚型及高、低风险组间肿瘤免疫微环境差异。结果 胃癌患者可分为两个PANoptosis分子亚型，亚型间患者的临床特征、预后、信号通路和肿瘤微环境有显著差异。根据PANoptosis相关基因在胃癌组织中的表达水平，经Lasso回归分析、多因素Cox回归分析，鉴定出6个关键基因（IRF2、AKT3、UNC5B、CYCS、CASP5、TICAM1）用于构建风险评分体系。多组学分析发现，风险评分与微卫星不稳定性、肿瘤突变负荷和肿瘤干细胞指数呈负相关关系。基于PANoptosis风险评分和临床病理因素构建诺莫图，预测胃癌患者1、3、5年生存率的受试者操作特征曲线下面积值分别为0.702、0.736、0.744。实时定量聚合酶链式反应实验证实风险基因CYCS、CASP5、TICAM1在胃癌细胞系中高表达（P <0.01）。结论基于胃癌PANoptosis相关基因构建的预后模型有望成为独立预测胃癌患者预后的指标。

关键词

胃癌 / 泛凋亡 / 分子亚型 / 预测模型 / 免疫微环境 / 生物信息学