构建双硫死亡相关长链非编码RNA模型预测胃癌患者预后及免疫相关分析

摘要

目的 构建双硫死亡相关长链非编码RNA (lncRNA)特征的胃癌预后模型，分析lncRNA与胃癌的肿瘤免疫微环境之间的关联并评估可能的免疫治疗。方法 下载TCGA-STAD的RNA测序数据和临床资料。使用共表达网络分析、Cox回归分析和LASSO回归建立与双硫死亡相关的lncRNA风险预后模型；使用受试者操作特征曲线等方法验证模型的预测能力；利用GSEA富集分析分析各组之间生物学功能的差异；评估与肿瘤微环境、免疫细胞、免疫功能间的关系。结果 收集了24个双硫死亡相关的基因，9种双硫死亡相关lncRNA用于创建预后模型。将患者分为高、低风险2个亚组，从生存曲线显示2组患者之间的总生存率差异有统计学意义（P<0.001），预测模型1、3、5年的受试者操作特征曲线下面积分别为0.681、0.703和0.789，显示有较强的预测能力，Cox回归分析显示风险评分是影响预后的独立因素（P<0.001）。高、低风险组在部分免疫细胞及免疫功能之间差异有统计学意义（P<0.05）。结论 基于9个双硫死亡相关lncRNA的风险评分模型有助于预测胃癌患者预后及免疫反应，可为患者的个体化治疗提供参考依据。

关键词

胃癌 / 双硫死亡 / 长链非编码RNA / 肿瘤微环境 / 免疫浸润

基金资助

甘肃省联合科研基金重大资助项目（23JRRA1501）;; 甘肃省自然科学基金资助项目（22JR5RA960）;; 兰州大学医学创新发展基金资助项目（lzuyxcx-2022-181）