双样本孟德尔随机化探索口腔溃疡与食管癌的因果关系

摘要

目的 采用双样本孟德尔随机化（MR）方法分析口腔溃疡与食管癌之间的因果关系。方法 通过全基因组关联分析（GWAS）数据库中口腔溃疡和食管癌的数据估计因果关系。口腔溃疡数据集包含336 138例样本和10 894 596个单核苷酸多态性（SNP），食管癌数据集来源于IEU数据库、FinnGen数据库和GWAS catalog数据库。采用逆方差加权法作为主要分析方法，并以MR-Egger回归法、加权中位数法、简单模式和加权模式作为补充。Cochran's Q检验用于异质性分析，MR-Egger截距及MR多效性残差和异常值全局检验评估水平多效性。采用留一法分析单个SNP对MR结果的影响。结果 逆方差加权法分析结果提示，口腔溃疡与不同数据库中食管癌的发病风险呈负相关关系，而反向MR未发现食管癌与口腔溃疡发生风险的因果关系（P>0.05）。正向和反向MR分析Cochran's Q检验提示ukb-a-427和ebi-a-GCST90018841、 ukb-a-427和finngen＿R12＿C3＿OESOPHAGUS＿EXALLC之间不存在异质性（P>0.05），但正向MR分析ukb-a-427和GCST003739之间存在异质性（逆方差加权法P=0.048,MR-Egger回归P=0.040），反向Cochran's Q提示无异质性（P>0.05）。MR Egger截距测试未发现水平多效性（P>0.05）,MR多效性残差和异常值未发现离群值，留一法分析结果表明MR结果可靠。结论 MR分析发现口腔溃疡与食管癌的发病风险存在负向因果关系。

关键词

孟德尔随机化 / 口腔溃疡 / 食管癌 / 因果关联 / 全基因组关联研究

基金资助

兰州市科技计划资助项目（2023-4-38）