基于线粒体自噬相关lncRNA构建胃癌预后预测模型

摘要

目的 基于线粒体自噬相关的长链非编码RNA(lncRNA)构建胃癌的预后预测模型。方法 从TCGA和GEO数据库获取与胃癌相关的RNA-seq数据和临床数据。通过维思图识别差异表达的线粒体自噬相关基因。使用Wilcoxon检验识别线粒体自噬相关lncRNA(MRLs)，采用单因素Cox回归、LASSO回归和多因素Cox回归分析，建立基于MRLs的胃癌预后模型。根据模型将患者分为实验组和验证组，并在验证队列中进一步评估该风险模型的预测价值。使用Kaplan-Meier生存分析、受试者操作特征曲线和主成分分析评估模型的准确性，进行GO和KEGG分析检查与风险模型相关的富集功能和通路。分析MRLs模型对各种胃癌药物的敏感性，利用ULCAN数据库验证模型lncRNA的表达及其对预后的影响。最后，使用lncSEA 2.0数据库分析LINC01614与胃癌肿瘤免疫微环境的关系。结果 获得6个线粒体自噬相关基因（COL1A1、 CHGA、 FN1、 SFRP4、 CHGB和CA2），并建立了一个包含4个线粒体自噬相关lncRNA(LINC01614、AC107021.2、AP005262.1和AC022467.1)的胃癌预后模型。Kaplan-Meier生存分析显示，高危组患者预后不良（P<0.001）。单因素和多因素Cox回归分析均表明MRLs风险评分是胃癌患者的独立预后指标，且该模型对5年生存率的预测具有较高的准确性（曲线下面积=0.740）。研究发现MRLs风险模型与胃癌患者的各种临床变量和多种药物敏感性特征显著关联。此外，还发现LINC01614与胃癌的肿瘤免疫微环境相关。结论 基于4个lncRNA的MRLs风险模型可以辅助评估胃癌患者的生存和药物敏感性，LINC01614有望成为胃癌治疗的新靶点。

关键词

线粒体自噬 / 胃癌 / 长链非编码RNA / 预测模型 / 风险评分 / 肿瘤免疫微环境