基于整合素家族基因构建及验证子宫内膜癌的预后模型

摘要

目的:通过筛选与子宫内膜癌(EC)预后相关的整合素家族基因，并根据最佳基因组合构建预后模型。方法:获取TCGA数据库中EC患者的转录组和临床数据。利用limma包筛选EC的差异表达基因，利用survminer包筛选EC预后相关基因。利用glmnet包提供的LASSO算法构建基于整合素家族基因的预后模型。利用Kaplan-Meier和ROC曲线评估预后模型的预测价值。利用多因素Cox回归分析对模型进行独立性分析。利用DOSE包、ClusterProfler包、GSVA包、GSEA软件包进行富集分析。利用TIDE算法预测免疫治疗应答效应。利用oncoPredict包进行药物反应预测。结果:构建由ITGA7、ITGAL、ITGA6、ITGB1BP2及ITGA10等整合素家族基因组成的EC预后模型。基于预后模型，高风险组的EC患者预后明显较低风险组患者更为不良，预后模型具备良好的预测效能且是EC的独立预后因素。高、低风险组患者在不同通路中富集。低风险组患者更可能从免疫治疗中获益，也更有可能从顺铂、阿糖胞苷、多西他赛、紫杉醇、他莫昔芬及长春瑞滨等药物治疗中获益。结论:基于整合素家族基因的预后模型是EC预后预测工具，有望指导患者的个性化治疗。

关键词

子宫内膜癌 / 整合素 / 预后模型 / 生物信息学