新疆地区宫颈癌妇女HPV16 E6基因T细胞抗原表位与HLA分子亲和能力预测

摘要

目的:研究新疆地区维、汉族宫颈癌妇女在不同遗传背景下HLA的多态性，分析HPV16 E6突变对T细胞抗原表位的影响，预测HLA分子与T细胞抗原表位的亲和力。方法:收集2017年至2020年于新疆维吾尔自治区人民医院妇科就诊的HPV16阳性宫颈鳞状细胞癌维吾尔族、汉族患者共52例，获取患者的血液及组织样本；通过高通量测序技术对其进行HLA分型分析，比较各等位基因在两民族中的分布频率；运用IEDB数据库对本研究团队前期研究中所获得的维吾尔族宫颈癌患者的HPV16 E6突变基因进行抗原表位预测及相关分析处理得到其候选表位，再利用NetMHCIIpan 4.0 Server与NetMHCpan 4.0 Server在线软件预测该抗原表位与HLA分子的亲和力变化。结果:新疆地区维、汉族宫颈癌患者之间存在显著差异的HLA基因型共有11个；HPV16 E6突变基因主要与14个T细胞抗原表位的变异有关；HPV16 E6突变导致的T细胞抗原表位112761、112929与HLA分子亲和力显著增强；HPV16 E6突变导致的T细胞抗原表位110846与HLA分子亲和力显著减弱。结论:新疆地区维族宫颈癌妇女HPV16 E6突变导致的T细胞表位的改变，可能是该人群HPV低感染率、宫颈癌高发率的免疫学原因之一。

关键词

HPV感染 / HLA多态性 / HPV16 E6突变 / T细胞抗原表位