猪miR-23a-27a-24簇启动子预测及活性分析

李清春; 孙晓梅; 孙敬礼; 黄涛

doi:10.13880/j.cnki.65-1174/n.2023.22.023

石河子大学学报（自然科学版） ›› 2023, Vol. 41 ›› Issue (03) : 279 -285. DOI: 10.13880/j.cnki.65-1174/n.2023.22.023

猪miR-23a-27a-24簇启动子预测及活性分析

李清春, 孙晓梅, 孙敬礼, 黄涛

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摘要

目的本研究旨在对猪miR-23a-27a-24簇(miR-23a-27a-24 cluster)的潜在启动子区域进行预测和分析，为进一步探索miR-23a-27a-24基因对猪转录调控机制的研究奠定基础。方法利于生物信息学分析猪miR-23a-27a-24簇的启动子区域、CpG岛及其潜在的转录因子；利用截短突变和PCR技术克隆得到5个逐级缺失的miR-23a-27a-24基因启动子片段，构建双荧光素酶报告载体，通过检测各载体的双荧光素酶活性获得miR-23a-27a-24基因的核心启动子区域。结果 pGL3-cMiR启动子在猪miR-23a-27a-24簇上游341bp至994bp区荧光素酶活性最强，为pGL3-basic空载体活性的5.02倍(P<0.05),视为miR-23a-27a-24簇核心启动区。生物信息学分析表明：猪miR-23a-27a-24簇启动子区不含CpG岛，其核心启动子区可能存在SP1、VDR、MAZ、YY1、E2F1和ELF1六种潜在的转录因子结合位点。结论本研究构建并确定了猪miR-23a-27a-24簇核心启动子区域，可为今后开展猪miR-23a-27a-24簇的转录调控机制奠定基础。