基于生物信息学筛选创伤后应激障碍差异表达基因及验证

摘要

目的 筛选创伤后应激障碍（PTSD）中的差异表达基因（DEG）并进行验证，进一步探讨PTSD可能发生的机制。方法 分别收集PTSD患者与健康人群的外周血单个核细胞（PBMC）各26例，根据实验设计分别分为基因筛选组（n₁=6）、基因验证组（n₂=20）。首先通过转录组测序技术（RNA-Seq）建立新的基因库，然后使用GO分析、KEGG分析等方法筛选出PTSD患者的DEG,并进行实时荧光定量聚合酶链式反应（q-RT-PCR）验证；募集参与者的血浆样本，对上述DEG进行酶联免疫吸附测定（ELISA）进一步验证。结果 （1）筛选出DEG共609个，其中448个基因上调表达，161个基因下调表达。（2）q-RT-PCR验证基因4个，其中FPR1与CD14的表达显著升高，且差异具有统计学意义（P<0.05）;XCL2与TIGIT的表达趋势呈下降，但差异不具有统计学意义（P<0.05）。（3）ELISA验证基因4个：其中CD14、FPR1、XCL2存在着蛋白水平的表达下调，差异具有统计学意义（P<0.05）;而TIGIT的蛋白水平表达无明显差异，且不具有统计学意义。结论 CD14与FPR1为PTSD发生发展过程中的相关关键基因，其可能通过炎症通路来对PTSD的发生发展产生影响，而XCL2和TIGIT与PSTD发生发展的关系仍有待探究。

关键词

创伤后应激障碍 / 差异表达基因 / CD14 / FPR1