基于生物信息学探究FRZB基因参与调控Wnt信号通路对肝癌预后的影响

摘要

目的 基于生物信息学与实验研究探讨卷曲相关蛋白(Frizzled-related protein 1 FRZB)参与调控Wnt信号通路对肝细胞癌(Hepatocellular carcinoma, HCC)预后的影响。方法 (1)通过(The Cancer Genome Atlas, TCGA)数据库获取HCC的RNA-Seq数据和临床资料，运用R软件分析FRZB mRNA在泛癌和肝癌中的表达差异。(2)选取石河子大学第一附属医院肝癌和正常肝脏石蜡包埋组织样本，通过免疫组化分析FRZB蛋白在两组间的表达差异。(3)分析FRZB与HCC临床特征的相关性，通过Kaplan-Meier生存分析评估FRZB的表达量与肝癌患者的预后关系。(4)基于TCGA数据库和(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes, KEGG)数据库获取Wnt通路相关基因，使用LASSO-Cox回归法构建肝癌预后模型并验证模型的预测效能，同时利用HCCDB数据库进行外部独立验证。(5)探讨FRZB与预后模型中基因的相关性。结果 TCGA数据库分析发现，FRZB mRNA在HCC组织中显著高表达，差异具有统计学意义(P<0.001);免疫组化显示其蛋白表达在HCC组织中同样显著上调；临床特征分析表明，FRZB与HCC患者的TN M分期、病理分级以及Child-pugh分级显著相关，FRZB高表达的HCC患者总生存期更长；通过LASSO-Cox回归得到并构建7个预后相关基因(CACYBP、FRAT2、PLCB3、RAC1、RAC3、RUVBL1、BL1XR1L)的风险预测模型，K-M生存分析表明高风险组患者的总生存期明显低于低风险组(P<0.05),ROC曲线显示该模型具有良好的预测能力；通过Spearman分析揭示FRZB与RAC3、CACYBP、RUVBL1负相关(P<0.05),与PLCB3正相关(P<0.05)。结论 FRZB可能通过调控Wnt信号通路相关基因对HCC预后产生影响，可能可以作为检测HCC患者预后的潜在生物标志物，为改善HCC的预后提供新的理论依据。

关键词

FRZB基因 / 肝细胞癌 / Wnt信号通路 / 预后 / 生物信息学