糙皮侧耳Hsp基因家族鉴定及其在热胁迫下的表达分析

任新辉, 郭李峰, 王静怡, 侯潞丹, 孟俊龙, 常明昌, 王术荣

中国瓜菜 ›› 2026, Vol. 39 ›› Issue (1) : 26 -38.

中国瓜菜 ›› 2026, Vol. 39 ›› Issue (1) : 26 -38. DOI: 10.16861/j.cnki.zggc.2025.0432

糙皮侧耳Hsp基因家族鉴定及其在热胁迫下的表达分析

    任新辉, 郭李峰, 王静怡, 侯潞丹, 孟俊龙, 常明昌, 王术荣
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摘要

热激蛋白(heat shock protein,Hsp)是生物体在热胁迫或其他环境刺激下产生的一类分子伴侣蛋白,在非生物胁迫响应中发挥重要作用。本研究以糙皮侧耳CCMSSCC00389菌株为研究对象,采用生物信息学方法对Hsp基因家族进行了鉴定及热胁迫下的表达模式分析。结果表明,糙皮侧耳基因组中共鉴定出了27个PoHsps,不均匀地分布在11条染色体上;基因启动子顺式作用元件分析结果表明,激素响应型的顺式作用元件占比最多;进一步研究发现,在不同温度热胁迫下,PoHsps表达模式大体可分为5类,其中PoHsp19随着温度的升高表达量逐渐下降;PoHsp7和PoHsp24在不同温度热胁迫下表达量无显著变化;PoHsp2、PoHsp4、PoHsp6和PoHsp15具有相似的表达模式,均呈先下降后升高的变化趋势;其他PoHsps随着胁迫温度的升高表达量均呈逐渐升高的变化趋势。由此表明,PoHsps在不同胁迫中可能存在功能差异。本研究结果为糙皮侧耳Hsp基因家族在非生物胁迫下的功能鉴定奠定了基础。

关键词

糙皮侧耳 / Hsp基因家族 / 热胁迫 / 生物信息学分析

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任新辉, 郭李峰, 王静怡, 侯潞丹, 孟俊龙, 常明昌, 王术荣. 糙皮侧耳Hsp基因家族鉴定及其在热胁迫下的表达分析[J]. 中国瓜菜, 2026, 39(1): 26-38 DOI:10.16861/j.cnki.zggc.2025.0432

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参考文献

基金资助

国家自然科学基金(32402654); 山西省科技重大专项计划“揭榜挂帅”项目(202301140601015); 山西农业大学博士科研启动项目(2021BQ90);山西农业大学“科技创新提升工程”项目(CXGC202429); 山西省重点研发计划(202402140601016)

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