NUF2对泛癌的预后和免疫治疗效果的预测价值

摘要

目的 探讨NUF2表达水平与肿瘤预后的关系及在肿瘤微环境中的作用。方法 综合利用人类蛋白质图谱（HPA）、癌症基因组图谱（TCGA）、基因型-组织表达计划（GTEx）、癌细胞系百科全书（CCLE）、TIMER的数据集，采用生物信息学方法挖掘NUF2的潜在致癌作用，包括剖析NUF2在各种类型肿瘤组织中的表达水平、预后价值及免疫价值；采用RT-qPCR、Western blotting、免疫组化（IHC）等实验检测NUF2在肝癌细胞系和肝癌患者癌组织及血液中的表达情况。利用基因本体论（GO）、基因组百科全书（KEGG）和基因集富集分析（GSEA）探索NUF2及相关基因的分子机制并在肝癌中构建了NUF2的竞争性内源RNA(ceRNA)网络。结果 与正常组织相比，NUF2表达在27种肿瘤中上调并与多种类型肿瘤的临床分期相关（P<0.05）。在部分肿瘤中，NUF2的表达上调与肿瘤患者的不良预后（总体生存期、疾病特异性生存期、无病生存期和无进展生存期）相关（P<0.05）。NUF2表达水平与多种肿瘤的肿瘤突变负荷、微卫星不稳定、浸润免疫细胞（B细胞、髓样树突状细胞、中性粒细胞、CD4+T细胞）、免疫细胞maker基因（CCR7、CD163、CD19、CD4、CD79A、CD8A、CD8B、IRF5、ITGAX和MS4A4A）以及免疫检查点基因（CTLA4、HAVCR2、LAG3、PDCD1和PDCD1LG2）呈正相关（P<0.05）。RT-qPCR等实验结果显示NUF2在肝癌细胞系、肝癌患者癌组织和血液中表达上调（P<0.05），其中肝癌患者经手术治疗之后，使得血液中NUF2表达下调（P<0.05）。GO和KEGG富集分析表明，NUF2相关基因与染色体分离、微管运动以及细胞周期相关（P<0.05）。GSEA分析提示，在肝癌中NUF2高表达与甘氨酸、丝氨酸和苏氨酸代谢以及调控神经活性配体受体相互作用有关（P<0.05）。结论 NUF2在27种肿瘤中表达上调并与部分肿瘤的临床分期、不良预后有关。此外NUF2的表达与多种肿瘤的免疫细胞浸润密切相关，可能作为这些癌症免疫治疗效果的潜在预测因子。

关键词

NUF2 / 泛癌分析 / 免疫浸润 / 预后