铁死亡相关基因对溃疡性结肠炎具有诊断预测价值

摘要

目的 探讨铁死亡相关基因在溃疡性结肠炎（UC）诊断和预测中的的价值。方法 本研究从GEO数据库中选择UC数据集，筛选差异表达基因（DEGs），进一步从“FerrDb“数据库中筛选与铁死亡相关的DEGs并进行功能分析。通过构建蛋白-蛋白相互作用网络（PPI）筛选枢纽基因，采用CIBERSORT评估UC与对照组的免疫浸润水平差异，以及利用训练集验证枢纽基因在UC诊断中的价值。进一步通过构建UC小鼠模型，利用实时荧光定量PCR(qPCR)检测小鼠结肠中枢纽基因的表达情况。结果 筛选到76个与铁死亡相关的差异表达基因。功能富集分析显示铁死亡和缺氧途径显著富集。蛋白相互作用网络确定了10个枢纽基因，经数据库验证有9个枢纽基因在UC中高表达。经免疫细胞浸润分析显示，27种细胞类型在UC中明显升高（P<0.05），免疫检查点相关基因均与枢纽基因PPARG相关性最强（P<0.05）。进一步通过训练集验证P4HB、PPARG、STAT3在疾病中预测价值最佳（P<0.05）。通过构建小鼠UC模型验证结肠组织中枢纽基因的表达水平，RT-PCR显示与对照组相比，UC模型中PPARG表达明显降低，P4HB、STAT3表达明显升高（P<0.05）。结论 铁死亡相关基因在UC的诊断预测中具有重要价值。

关键词

溃疡性结肠炎 / 铁死亡 / 免疫浸润 / PPARG / T细胞