皮肤黑色素瘤中MMRN2高表达促进肿瘤细胞的侵袭和迁移并与不良预后相关

摘要

目的 采用生物信息学探讨多聚蛋白-2(MMRN2)抑制皮肤黑色素瘤（SKCM）生长和转移的影响。方法 从GEO数据库获得SKCM患者的临床信息，比较正常组织和黑色素瘤中MMRN2的表达差异；通过STRING数据库获得和MMRN2互相作用蛋白，构建蛋白网络，利用GEPIA2.0数据库下载SKCM中MMRN2相关性基因，对交集基因进行GO/KEGG功能富集分析；利用“timeROC”包处理数据，使用“stats”包和“car”包，分析MMRN2和SKCM的临床相关性；使用survival包进行比例风险假设检验并进行Cox回归分析筛选独立预后因素并构建临床列线图；利用GSCA数据库和ssGSEA算法分析MMRN2与免疫细胞浸润的相关性；利用Spearman分析研究MMRN2和血管生成相关基因的相关性；集落克隆、transwell、划痕实验检测SKCM细胞的增殖和转移能力；采用HE染色观察病理学变化；Kaplan-Meier曲线观察生存时间；ELISA实验检测黑色素瘤细胞上清中GM-CSF、CXCL9、TGF-β1的表达水平。结果 MMRN2在SKCM转移瘤中的水平升高（P<0.001）；在STRING数据库中获得30个互作分子构建蛋白互作网络，和GEPIA2.0数据库中获得的基因取交集得到15个共同基因，进行GO/KEGG分析主要是是endothelium development、cell-cell junction等。在SKCM患者中MMRN2高表达的患者预后更差，MMRN2的水平在pathologic T satge、breslow depth、melanoma ulceration中差异具有统计学意义（P<0.05），免疫浸润结果显示，MMRN2和24中免疫细胞丰度呈正相关（P<0.001），并与肿瘤成纤维细胞和内皮细胞具有较强的正相关性（P<0.001）,MMRN2的表达水平和大多数血管生产基因的表达水平呈正相关，和KCNJ8、SLCO2A1、NRP1、COL3A1的表达相关性较强（P<0.001）；敲低MMRN2后，SKCM细胞B16F10的增殖（P<0.01）、侵袭和迁移能力减弱（P<0.01），重塑免疫微环境（P<0.001），进而抑制黑色素瘤的转移。结论 多聚蛋白-2可能成为治疗SKCM的新靶点，为SKCM的诊断和治疗提供新的策略与思路。

关键词

多聚蛋白-2 / 黑色素瘤 / 预后 / 生物信息学 / 免疫浸润