环状RNA在口腔白斑和口腔扁平苔藓中的共同表达

摘要

目的 探讨环状RNA在口腔白斑（oral leukoplakia,OLK）和口腔扁平苔藓（oral lichen planus,OLP）疾病发生发展中的共同表达，为研究OLK与OLP的发病机制及癌变机制提供基础。方法 本研究获得医院伦理审批。采用高通量测序技术检测OLK、OLP、口腔鳞状细胞癌和正常口腔黏膜组织中差异表达的circRNA，采用qRTPCR、酶耐受实验和sanger测序筛选并验证OLK与OLP中共同显著差异表达circRNA，并对关键circRNA扩大样本量验证；采用GO和KEGG富集分析差异circRNA可能涉及的生物学过程及信号通路；采用TargetScan与MiRanda预测circRNA下游的miRNA并绘制ceRNA网络。结果 OLK与OLP共同差异表达的circRNA共49个，包括30个上调和19个下调的circRNA；经验证，筛选的3个上调circRNA(circHLA-C,circTTN,circRNF13)和2个下调circRNA(circSEPN2,circALDH3A2)表达趋势与测序结果一致。其中circHLA-C是具有反式剪接位点的关键circRNA，经扩大样本量验证，circHLA-C在OLK与OLP中显著上调。ROC曲线分析显示，OLK中circHLA-C曲线下面积为0.955,OLP中circHLA-C曲线下面积为0.988。GO功能富集显示与免疫功能生物学过程密切相关，KEGG通路分析中富集分数最高的信号通路是“自然杀伤细胞介导的细胞毒性”，HLA-C在这些通路中显著富集，ceRNA网络分析表明circHLA-C可能与多种癌症相关miRNA相互作用，如hsa-miR-26a-5p、hsa-miR-129-5p和hsa-miR-29a-3p。结论 OLK与OLP存在相同差异表达的circRNA,circHLA-C是OLK与OLP共有的最显著上调的circRNA;circHLA-C可能会成为OLP与OLK诊断和预后的潜在生物标志物。

关键词

环状RNA / circHLA-C / 口腔白斑病 / 口腔扁平苔藓 / 口腔黏膜潜在恶性疾病 / 癌变 / 生物标志物 / 高通量测序