miR-135b-5p在口腔鳞状细胞癌中的表达及相关生物信息学分析

赵格, 黎昌学, 郭超, 朱慧

口腔疾病防治 ›› 2022, Vol. 30 ›› Issue (01) : 27 -32.

赵格, 黎昌学, 郭超, 朱慧

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摘要

目的探索miR-135b-5p在口腔鳞状细胞癌(oral squamous cell carcinoma,OSCC)及癌旁组织中的表达及其临床意义,预测miR-135b-5p靶基因并进行相关生物信息学分析。方法通过肿瘤与癌症基因图谱(the Cancer Genome Atlas,TCGA)、基因表达数据库(Gene Expression Omnibus,GEO)数据库分析miR-135b-5p在OSCC组织和癌旁组织中的表达并分析其临床意义;临床收集新鲜组织标本,采用实时荧光定量PCR验证不同组织中miR-135b-5p的表达情况。采用生物信息学方法预测miR-135b-5p的靶基因并进行通路富集分析。构建蛋白互作网络筛选关键靶基因。结果 OSCC组织中miR-135b-5p表达量较癌旁组织上调,差异有统计学意义(P <0.001);miR-135b-5p表达量对OSCC组织具有良好的诊断效能(AUC=0.960,P <0.001);OSCC组织中miR-135b-5p表达水平与组织病理分级相关(P=0.011);生信分析结果显示,miR-135b-5p的靶基因富集在与肿瘤相关的钙离子、cGMP-PKG、cAMP信号通路中;筛选得到10个关键靶基因:DLG2、ANK3、ERBB4、SCN2B、NBEA、GABRB2、ATP2B2、SNTA1、CACNA1D、SPTBN4。结论 miR-135b-5p可作为一种促癌基因参与OSCC的发生发展,并具有成为OSCC诊断标志物及治疗靶点的潜在应用价值。