2个非综合征型先天缺牙家系的MSX1基因突变检测与分析

摘要

目的 对2个非综合征型先天缺牙家系进行突变筛查及分析，为先天缺牙的诊断和治疗提供依据。方法 本研究已通过单位医学伦理委员会审查批准，并获得患者知情同意。收集了2个非综合征型先天缺牙核心家系的信息及血液样本，另外收集了100例正常对照的血液样本。通过外显子测序及Sanger测序来探索致病基因突变。使用预测软件Polyphen-2、CADD及fammth分析所发现的突变的致病性。使用Mupro、DUET和I-Mutant软件预测突变对蛋白质稳定性的影响。使用保守性分析及蛋白质二维/三维结构分析来预测突变对蛋白质功能的影响。使用DeepLoc 2.1软件预测突变蛋白对亚细胞定位的影响。结果 在本研究2个家系中发现了肌节同源异性盒基因1(muscle segment homeobox 1,MSX1)的2个新突变：c.547C>A(p.Gln183Lys)和c.854 T>C(p.Val285Ala)。Polyphen-2、CADD及fammth预测这2个突变存在致病性，ACMG分类这2个突变可能致病。保守性分析显示这2个突变位点（Gln183和Val285）位于进化过程中高度保守区域。蛋白质稳定性预测这2个突变对蛋白质稳定性造成影响。蛋白质二维结构分析显示这2个突变会对蛋白质二维结构造成影响。三维结构分析显示这2个突变造成了三维结构的改变。软件预测这2个突变对蛋白质的亚细胞定位没有影响。结论 本研究首次报道了MSX1基因的2个突变（c.547C>A和c.854 T>C）可以导致先天缺牙，为先天缺牙诊断和治疗提供了依据。

关键词

先天缺牙 / 基因突变 / 肌节同源异性盒基因1 / 遗传病 / 发育异常 / 突变筛查 / 外显子测序 / 遗传咨询