北柴胡种子内生菌群落结构与多样性

摘要

为研究北柴胡种子内生菌的群落结构与多样性。采用Illumina Miseq高通量测序技术,分别对山西(BC＿1)、黑龙江(BC＿2)、河北(BC＿3)和内蒙古(BC＿4)的四个产地(4份)北柴胡种子的16S RNA V3-V4区和ITS1区扩增片段进行测序,并对内生细菌和内生真菌群落结构和多样性进行分析。结果表明,BC＿3内生细菌与内生真菌丰富度与多样性最高,BC＿4内生菌丰富度最低。4种不同产地北柴胡种子共有的内生细菌优势菌门为变形菌门(Proteobacteria),占77.77%;内生真菌优势菌门为担子菌门(Basidiomycota),占67.82%。共有的内生细菌优势菌属为鞘脂单胞菌(Sphingomonas),占18.30%,内生真菌优势菌属为Papiliotrema(41.35%)。种水平内生真菌丰度水平较高的为金黄蝶形担孢酵母(Papiliotrema aurea),占38.67%;内生细菌丰度水平较高的为根球假单胞菌(Pseudomonas rhizosphaerae),占15.56%。在属水平上,4种不同产地北柴胡种子中内生细菌与内生真菌群落结构均有差异。北柴胡种子内生菌资源丰富,功能多样,对北柴胡种子萌发和生长发育具有重要影响。

关键词

北柴胡种子 / 内生菌多样性 / 高通量测序