基于高通量培养组学的人体皮肤细菌多样性研究

摘要

了解中国健康人皮肤可培养细菌多样性及建立中国健康人皮肤细菌菌株资源库，能够为皮肤细菌研究及研究皮肤细菌与皮肤疾病之间的潜在关系提供菌株资源。通过高通量培养组学技术，利用9种培养基对18名健康中国人，8个部位，144份皮肤样品进行高通量分离培养，并对筛选获得的细菌进行16S rRNA测序鉴定分析。研究表明，共分离获得3 580株细菌，隶属于4门33属108种；4个门包括厚壁菌门（Firmicutes）、放线菌门（Actinobacteria）、变形菌门（Proteobacteria）和拟杆菌门（Bacteroidetes），其中优势门为厚壁菌门（占总菌株数的87.01%），其次为放线菌门（10.61%）；优势属为葡萄球菌属（Staphylococcus）（占总菌株数的82.07%）；优势种为表皮葡萄球菌（Staphylococcus epidermidis）（占总菌株数的35.81%），其次为人葡萄球菌抗新霉素败血症亚种（Staphylococcus hominis subsp. novobiosepticus）(26.37%)及头状葡萄球菌（Staphylococcus capitis）(9.44%)；并获得39株26种潜在的新菌种，其与最接近的16S rRNA序列相似率分布为88.26%～98.61%，潜在新属新种占总菌株的1.09%，占所有菌种的24.07%。健康中国人群皮肤细菌资源丰富，且存在大量的潜在新属新种有待分离培养鉴定；我们初步建立了健康中国人皮肤细菌资源库，以丰富现有皮肤细菌资源，为利用皮肤细菌资源提供菌株保障。

关键词

培养组学 / 人体皮肤细菌 / 可培养细菌 / 16S rRNA鉴定