纳木措湖沿岸表层水细菌群落特征及影响因素

孟华旦尚, 薛文凯, 薛曌, 王艳红, 郑艳艳, 德吉, 郭小芳

生物资源 ›› 2022, Vol. 44 ›› Issue (05) : 432 -444.

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生物资源 ›› 2022, Vol. 44 ›› Issue (05) : 432 -444. DOI: 10.14188/j.ajsh.2022.05.002

纳木措湖沿岸表层水细菌群落特征及影响因素

    孟华旦尚, 薛文凯, 薛曌, 王艳红, 郑艳艳, 德吉, 郭小芳
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摘要

为了探究夏季纳木措湖沿岸表层水体细菌群落特征,为以后纳木措湖细菌的研究打下基础,围绕纳木措湖一周选取采样点19个。现场采集水样,进行理化因子测定,运用高通量测序技术获取上述样点的16S rDNA数据,根据多样性指数和丰富度指数计算比较各样点的细菌群落多样性和丰富度,根据各样点细菌群落在门和属水平的分布来研究纳木措各样点细菌分布差异,基于Spearman相关性系数来衡量理化因子与α-多样性指数的相关性,采用冗余分析(redundancy analysis,RDA)探究理化因子与细菌群落分布之间的关系。在纳木措水体中共获得细菌4 137个OTU(operational taxonomic units),属于87门204纲498目645科1 185属。门水平优势菌群为变形菌门(Proteobacteria,39.61%)、拟杆菌门(Bacteroidetes,13.41%)和厚壁菌门(Firmicutes,12.61%),其中,变形菌门以γ-变形菌为优势菌群,其次为β-变形菌和α-变形菌。属水平有71.67%的未知细菌菌属。纳木措Shannon多样性指数显示,纳木措细菌种类比较丰富。Spearman相关性系数显示,水体细菌α-多样性指数与环境因子之间没有相关性。RDA分析表明,影响纳木措水体细菌群落结构的主要理化因子为温度(P=0.002,F=5.7)。纳木措沿岸表层水体细菌群落分布差异较为明显,细菌群落比较丰富,有许多未知菌种需进一步鉴定,有广阔的研究前景。

关键词

纳木措湖 / 高通量测序 / 细菌群落 / 环境因子

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纳木措湖沿岸表层水细菌群落特征及影响因素[J]. 生物资源, 2022, 44(05): 432-444 DOI:10.14188/j.ajsh.2022.05.002

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