基于转录组数据藏波罗花WRKY转录因子鉴定与表达分析

摘要

为了解在藏波罗花中转录因子WRKY基因家族的结构和组织特异性表达情况，进而为其特征成分萜类化合物的合成与调控提供一定的借鉴，本研究从藏波罗花的转录组数据中共鉴定出了38个WRKY转录因子，进行生物信息学分析。根据WRKY转录因子保守结构域将38个藏波罗花WRKY转录因子分为三类（Ⅰ，Ⅱ，Ⅲ），长度为115～623。表达量分析结果表明，有16个转录因子在叶和根中差异表达，其中10个在叶中显著上调，6个在根中显著上调。选取了5条WRKY转录因子进行qRT-PCR验证，结果与转录组数据相一致，表明转录组数据可靠。这些在藏波罗花中不同组织之间的差异WRKY转录因子可能在应对极端环境和介导组织特异性次生代谢产物方面发挥作用，这也为后续探究植物在应对高海拔极端环境和次生代谢产物的合成与积累提供一定的帮助。

关键词

药用植物 / 藏波罗花 / WRKY转录因子 / 转录组分析