全班合作设计一个蛋白质

黄湘茹 ,  宁雪媛 ,  韩楠玉 ,  王重力 ,  许波

实验教学与仪器 ›› 2025, Vol. 42 ›› Issue (6) : 60 -61.

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实验教学与仪器 ›› 2025, Vol. 42 ›› Issue (6) : 60 -61. DOI: 10.19935/j.cnki.1004-2326.2025.06.019
实验教学案例

全班合作设计一个蛋白质

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摘要

以高中生物学内容“基因指导蛋白质的合成”为载体,利用模拟游戏开展教学活动,并引入“SWISS-MODEL”蛋白质自动建模平台,增加游戏趣味性,帮助学生掌握生物学知识,建构核心概念,培养探究实践和解决问题能力。

Graphical abstract

关键词

模拟游戏 / SWISS-MODEL / 蛋白质 / 信息技术 / 高中生物学

Key words

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黄湘茹,宁雪媛,韩楠玉,王重力,许波. 全班合作设计一个蛋白质[J]. 实验教学与仪器, 2025, 42(6): 60-61 DOI:10.19935/j.cnki.1004-2326.2025.06.019

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著名教育学家陈鹤琴说过“游戏是儿童的生命”,将游戏运用于教学中促进学生主动学习,常常可以达到事半功倍的效果[1]。模拟游戏结合了游戏的快乐特性和模拟的形象化、生活化特点,能够将复杂抽象的知识概念转化为直观生动的可视化过程[2]。相比传统“教师讲、学生听”的授课方式,模拟游戏可以提升课堂参与度,有效激活单调沉闷的课堂氛围。高中生物学致力于从细胞与分子层面解释生命现象及其本质,学生往往难以理解细胞内部的生理生化过程[3]。结合信息技术资源,将模拟游戏应用于高中生物学教学,不仅能够满足学生“亲历”细胞中难以直接观察的微观过程,还能让学生在游戏过程中感受生命科学的本质和内涵,达到“寓教于乐”的目的。

1 教材分析

“基因指导蛋白质的合成”是人教版高中生物学必修2《遗传与进化》第4章第1节的内容。课标中的内容要求为:概述DNA分子上的遗传信息通过RNA指导蛋白质的合成,要求学生能认识到生命活动不仅需要物质和能量,也需要信息[4]。教材中本节内容包含“遗传信息的转录”“遗传信息的翻译”和“中心法则”三大板块,主要从分子遗传学的层面阐述基因的表达过程,涉及“基因”“转录”“翻译”“遗传密码”“中心法则”等遗传学概念,重点是遗传信息的转录和翻译过程,难点是遗传信息的翻译过程。

2 设计思路

基于重要知识点,针对遗传信息从DNA传递至蛋白质这一细微、动态、抽象复杂的过程设计了3个游戏环节(图1)。在讲授“基因指导蛋白质的合成”理论知识后开展游戏,让学生在动手动脑的学习过程中内化知识、建构概念、筑牢生物学知识框架。活动首先采用“中心法则”模拟游戏,自制陀螺获得DNA链序列;其次在表格中依次写出对应的mRNA和氨基酸序列,完成转录和翻译过程;然后,基于信息技术平台“SWISS-MODEL”蛋白质自动建模网站,将获得的氨基酸序列转换为蛋白质的空间结构。整个活动过程以学生为主体,通过小组合作和探究学习将细胞内微观的生命过程直观化、具体化,更好地让学生体验生命信息从DNA到蛋白质的传递。

3 目标要求

(1) 通过模拟游戏掌握遗传信息的表达和传递是一个动态的、相互协调配合的过程,认同基因的表达是遗传信息在DNA、RNA及蛋白质中的传递过程,形成生命是物质、能量和信息的统一体的生命观念。

(2) 通过在游戏中再现转录和翻译过程,说出遗传信息、密码子、反密码子的关系,概述遗传信息的传递规律,发展获取信息、归纳与概括的科学思维。

(3) 通过动手实践和分组合作,提升合作意识,培养观察与提问的科学探究能力和自主学习能力。

(4) 通过课后任务引入现实中各类酶产品,让学生体会蛋白质在生产生活中的重要作用,培养社会责任感。

(5) 通过信息技术的运用,初步掌握利用SWISS-MODEL网站模拟蛋白质合成的具体操作,加强生物学学科与科学技术的联系,提升学生的科研素养。

4 “全班合作设计一个蛋白质”模拟游戏设计

4.1 “中心法则”模拟游戏

(1) 游戏准备。

全班学生每2人1组,共25个小组,每组1份活动材料。材料包括1个正八边形陀螺,1份游戏表格,1份氨基酸英文字母缩写对应表。

(2) 活动流程如表1所示。

4.2 “建构蛋白质”模拟游戏

(1) 技术支持。

SWISS-MODEL网站(https://swissmodel.expasy.org/)是瑞士生物信息学研究所建立的分子建模服务系统,能依据与蛋白质序列相似的已知蛋白,建立未知结构蛋白的分子模型。即从目标蛋白质的氨基酸序列出发,使用同源建模法预测该蛋白质的三级结构,建立蛋白质的模拟3D模型;待网站运行结束后会得到目标序列的蛋白质三维结构预测结果,将鼠标随机移动至肽链某处,可以看到位于该处的氨基酸的英文名称缩写和位置序号,点击页面相应按钮还可以对该3D模型进行旋转、保存等操作。

(2) 游戏准备。

按照FASTA格式要求准备序列,使用单一字母表示每个氨基酸。每个小组根据氨基酸英文缩写对应表,将活动一所得到的8个氨基酸转化为对应的英文字母序列,依次将结果展示在黑板上,最后全班得到长度为200的氨基酸英文序列,并将序列的第一个字母设为M即起始密码子;每个小组配备1台联网计算机。

(3) 活动流程如表2所示。

5 活动反思

在活动开始前,教师可以带领学生复习DNA转录、mRNA翻译及中心法则等重要概念,以便学生在实际操作过程中实现理论与实践的结合,确保活动质量。由于最终得到的氨基酸序列完全随机,可能出现SWISS-MODEL建构的蛋白质效果不佳,或因序列无法有效识别而建构失败等现象。为此,教师可提前准备已知蛋白质序列(如教材中出现过的血红蛋白),通过SWISS-MODEL查询其三维结构用于现场演示。

参考文献

[1]

邓江萍.游戏教学在高中生物课堂教学中的应用[J].课程教材教学研究(教育研究),2014(02):39-40.

[2]

林亚.模拟游戏激活高中生物课堂[J].中学生物学,2016,32(08):53-54.

[3]

高秀峰.浅谈如何在高中生物教学中实施游戏教学法[J].中学生物教学,2016(22):28.

[4]

中华人民共和国教育部. 普通高中生物学课程标准(2017年版2020年修订) [S].北京:人民教育出版社,2020.

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